Stichting Howu-Howu is in Nederland opgericht. Sinds 2002 bestaat er een afdeling in Indonesie. Het bestuur bestaat in 2006 uit zes bestuursleden. Twee bestuursleden zijn afkomstig uit Indonesie, uit respectievelijk Nias en Siberut. Het bestuur komt 3 tot 4 keer per jaar bij elkaar. De bestuursleden hebben allen zitting in een werkgroep. Er zijn vier werkgroepen: de werkgroep scholenproject, de werkgroep communicatie, de werkgroep fondsenwerving en de werkgroep interne organisatie. De werkgroepen komen regelmatig bij elkaar. Via de bestuursleden worden de plannen van de werkgroepen in het bestuur besproken en besluiten genomen. Het bestuur van de afdeling in Indonesie telt 4 personen. Zij besturen op afstand. In Indonesie vormt de vaste kern van coördinatoren het verantwoordingskader. Zij rapporteren aan het bestuur in Nederland. Op haar beurt legt het bestuur van Howu-Howu in Nederland verantwoording af aan de donors. De activiteiten van Howu-Howu richten zich primair op de bevolking van Nias en Siberut die op verschillende wijzen benaderd worden vanuit hun positie als belanghebbenden. Als ‘zij die ontvangen”, ‘zij die mee vorm en uitvoering geven aan projecten’ en als ‘zij die meebeslissen over’.

Howu-Howu telde in 2005 500 donateurs. Naast donaties van particulieren, ontving Howu-howu gelden van verschillende (bestuurlijke) organisaties en instellingen. Howu-Howu krijgt niet alleen (geldelijke) steun vanuit Nederland, maar ook uit Luxemburg, Belgie, Frankrijk en Denemarken. HH wil haar activiteiten op een doelmatige manier uitvoeren. Samenwerking is dan onontbeerlijk. Met: (vertegenwoordigers van) de plaatselijke bevolking, Indonesische NGO’s die op de eilanden zijn gevestigd, kerken, lokale overheid en lokale volksvertegenwoordigers, internationale hulporganisaties die op de eilanden actief zijn, organisaties vanuit particulier initiatief. Om informatie en ervaringen uit te wisselen en te komen tot een betere afstemming van de werkzaamheden. De vertegenwoordigers van HH op Nias zijn uitsluitend Niassers. Daarin onderscheidt HH zich van veel andere organisaties en initiatieven. Juist de inbreng van deze Niassers in een breder verband kan ertoe leiden dat een meer actieve inbreng vanuit Niassers bij de programma’s tot stand kan komen. Op Siberut is nog geen ervaring opgedaan met het werken met een team van Mentawaiers. De uitvoering van de activiteiten lenen zich daar minder voor. In de komende jaren zal blijken of er afhankelijk van de activiteiten die HH op dit eiland nog verder gaat opzetten, behoefte is aan de formatie van een team op Siberut. Specifiek voor de activiteiten op Nias geldt dat er contacten zijn met partijen die in het kader van de wederopbouw activiteiten ondernemen. Verder met partijen op Aceh die een rol vervullen in de wederopbouw in deze regio en met vertegenwoordigers van het Nationale Rehabilitatie Team (BRR).

Vanuit Nederland legt het team van HH contacten met partijen als fondsen, (internationale) hulporganisaties, particuliere initiatieven op het gebied van ontwikkelingssamenwerking, bedrijfsleven, COS, scholen (basis- en voortgezet onderwijs en MBO en HBO) en serviceclubs. En verder met in Nederland en buiten Nederland gevestigde organisaties of instellingen die zich willen inzetten voor het welzijn van de bewoners van Nias en Siberut.  Met als doel het verwerven van middelen (geld, kennis, goederen of diensten) om de activiteiten op de eilanden en in Nederland uit te kunnen uitvoeren. Het team in Nederland zet middelen in voor het geven van informatie en voorlichting (website, presentaties, nieuwsbrief, presenteren van beeldmateriaal, het maken van lespakketten over Nias en Siberut voor scholen), donateurwerving (bijvoorbeeld donateurbijeenkomst), communicatie en interne organisatie.